Как да отворите, редактирате и конвертирате PDB файлове
Файлът с разширение на файла с PDB е най-вероятно файл, създаден във формат на програмна база данни, който се използва за задържане на информация за отстраняване на грешки за програма или модул, като DLL или EXE файл. Те понякога се наричат символни файлове.
PDB файловете картографират различни компоненти и изрази в изходен код към своя окончателно компилиран продукт, който дебъгерът може да използва за намиране на файла източник и местоположението в изпълнимия файл, в който трябва да спре процеса на отстраняване на грешки.
Някои PDB файлове може да са във файловия формат на банката за данни на протеини. Тези PDB файлове са обикновени текстови файлове, които съхраняват координатите по отношение на протеиновите структури.
Другите PDB файлове вероятно са създадени в Palm Database или PalmDOC файловия формат и се използват с PalmOS мобилната операционна система . Някои файлове в този формат използват вместо това разширението .PRC файла.
Как да отворите PDB файл
Различните програми използват свой собствен PDB файл, за да съхраняват данни в някакъв структуриран формат на база данни, така че всяко приложение се използва за отваряне на собствен тип PDB файл. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio и Pegasus са само няколко примера за програми, които могат да използват PDB файл като файл на база данни. Radare и PDBparse може да работят и за отваряне на PDB файлове.
Някои PDB файлове се съхраняват като обикновен текст, като Genies 'Database Debug Database Files и са изцяло човешки четими, ако се отворят в текстов редактор. Можете да отваряте този вид PDB файл с всяка програма, която може да чете текстови документи, като например вградената програма на Notepad в Windows. Някои други зрители и редактори на PDB файлове включват Notepad ++ и скоби.
Другите файлове на PDB база данни не са текстови документи и са полезни само когато са отворени с програмата, за която е предназначена. Например, ако вашият PDB файл е свързан по някакъв начин с Quicken, опитайте да го използвате, за да видите или редактирате PDB файла. Visual Studio очаква да види PDB файл в същата папка като DLL или EXE файла.
Можете да преглеждате и редактирате PDB файловете, които са файлове на Protein Data Bank в Windows, Linux и macOS с Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB и USCF Chimera също могат да отварят PDB файл. Тъй като тези файлове са обикновен текст, можете да отворите PDB файла и в текстов редактор.
Palm Desktop трябва да може да отваря PDB файлове, които са във файловия формат на Palm Database, но може би ще трябва първо да го преименувате така, че да има разширение .PRC файла за тази програма, за да го разпознае. За да отворите PalmDOC PDB файл, опитайте STDU Viewer.
Как да конвертирате PDB файл
Файловете на програмните бази данни най-вероятно не могат да бъдат конвертирани в различен файлов формат, поне не с обикновен инструмент за конвертиране на файлове . Вместо това, ако има някакъв инструмент, който може да конвертира този вид PDB файл, ще бъде същата програма, която може да го отвори.
Например, ако трябва да конвертирате файла с PDB база данни от Quicken, опитайте да използвате тази програма, за да го направите. Този тип конвертиране обаче вероятно не само е с малка полза, но и не се поддържа в тези приложения на база данни (вероятно не е нужно да конвертирате този вид PDB файл в друг формат).
Файловете на Protein Data Bank могат да бъдат преобразувани в други формати с MeshLab. За да направите това, може да е необходимо първо да конвертирате PDB файла в WRL с PyMOL от менюто File> Save Image As> VRML и след това да импортирате WRL файла в MeshLab и да използвате менюто File> Export Mesh As, за да конвертирате ППБ файл в STL или друг файлов формат.
Ако не е нужно моделът да е цветен, можете да експортирате PDB файла директно в STL с USCF Chimera (връзката за изтегляне е по-горе). В противен случай можете да използвате същия метод, както по-горе (с MeshLab), за да конвертирате PDB в WRL с USCF Chimera и след това да експортирате WRL файла в STL с MeshLab.
За да конвертирате PDB в PDF или EPUB , ако имате PalmDOC файл, е възможно няколко начина, но най-лесно е да използвате онлайн PDB конвертор като Zamzar . Можете да качите своя PDB файл на този уеб сайт, за да имате възможност да го преобразувате в тези формати, както и в AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT и други формати на електронни книги.
За да преобразувате PDB файла в FASTA формат, можете да го направите с онлайн PDB на Meiler Lab към FASTA конвертор.
Също така е възможно да преобразувате PDB в CIF (Crystallographic Information format) онлайн, като използвате PDBx / mmCIF.
Разширено четене на PDB файлове
Можете да прочетете много повече за файловете с базата данни на програмата от Microsoft, GitHub и Wintellect.
Има още какво да научите за файловете на Protein Data Bank. вижте Worldwide Protein Data Bank и RCSB PDB.
Файлът ви все още не се отваря?
PDB файлове, които не се отварят с някой от инструментите от по-горе, вероятно не са всъщност PDB файлове. Това, което може да се случи, е, че премазвате файловото разширение; някои файлови формати използват наставка, която много прилича на ".PDB", когато те наистина не са свързани и не работят по същия начин.
Например, PDF файлът е файл с документи, но повечето от програмите от по-горе няма да изобразяват правилно текста и / или изображенията, ако се опитате да отворите такъв с тези софтуерни програми. Същото важи и за други файлове с подобно разширение на файловете, като PD, PDE, PDC и PDO файлове.
PBD е друга, която принадлежи на програмата Todo Backup на EaseUS и следователно е полезна само при отваряне с този софтуер.
Ако нямате PDB файл, проучете файловото разширение, което имате във файла, за да намерите подходящата програма, която го отваря или преобразува.